当院外科は、４つの部門より構成されます。すなわち消化管外科、肝胆膵外科、乳腺外科、そして血管外科です。各部門にそれぞれの専門医を配し、年間1,600例を超える手術及びカテーテル治療を行っています。消化管外科は食道癌、胃癌、大腸癌などの悪性疾患および腸閉塞、炎症性腸疾患、消化管穿孔、虫垂炎、鼠径へルニアなどの良性疾患を扱い、年間約550例の手術を行っています。肝胆膵外科では、肝癌、胆嚢癌、胆管癌、膵癌などの悪性疾患および胆石症、胆嚢炎などの良性疾患を扱い、年間350例を超える手術を行っています。鏡視下手術（腹腔鏡および胸腔鏡下手術）は、全消化器外科領域に導入され、胆嚢摘出、肝切除、膵切除、脾臓摘出、食道亜全摘、胃切除、大腸切除、虫垂切除、ヘルニア根治術などを行っています。近年は、胃癌および直腸癌に対してはロボット支援下での鏡視下手術を行っています。乳腺外科では乳腺の悪性および良性疾患の診断・治療を行っています。治療は手術療法、薬物療法、放射線療法などが行われます。乳癌に関連した手術は年間約100例です。血管外科では腹部大動脈瘤、腸骨動脈瘤、内臓動脈瘤、動脈閉塞症、下肢静脈瘤、深部静脈血栓症といった疾患を扱い、診断から手術・血管内治療まで一貫して診療を進めています。血管外科で扱う症例数は年間600例を超えます。豊富な症例数を元に、全国的な臨床研究も積極的に行っています。また、松山医療圏の二次救急医療を担っており、外科では消化管穿孔、腸閉塞、胆嚢炎、虫垂炎などの急性腹症、外傷、および動脈瘤破裂などの対応を行っています。

　以上より当院外科においては外科疾患について幅広い分野での研修が可能です。