当院外科は、４つの部門より構成されます。消化管外科、肝胆膵外科、乳腺外科、そして血管外科です。各部門にそれぞれの専門医を配し、年間1,650例を超える手術及びカテーテル治療を行っています。消化管外科は食道癌、胃癌、大腸癌などの悪性疾患、および腸閉塞、炎症性腸疾患、消化管穿孔、虫垂炎、鼠径へルニアなどの良性疾患を扱い、年間550例を越える手術を行っています。肝胆膵外科では、肝癌、胆嚢癌、胆管癌、膵癌などの悪性疾患、および胆石症、胆嚢炎などの良性疾患を扱い、年間330例を超える手術を行っています。鏡視下手術（腹腔鏡および胸腔鏡下手術）は、全消化器外科領域に適応され、胆嚢摘出、肝切除、膵切除、脾臓摘出、食道切除、胃切除、大腸切除、虫垂切除、ヘルニア修復術などが行われています。近年は、胃癌、結腸癌、肝癌、膵癌および直腸癌に対しロボット支援下での鏡視下手術が積極的に行われています。乳腺外科では乳腺の悪性および良性疾患の診断・治療を行っています。治療は手術療法、薬物療法、放射線療法などが行われます。乳癌に関連した手術症例数は年間約150例です。血管外科では腹部大動脈瘤、腸骨動脈瘤、内臓動脈瘤、動脈閉塞症、下肢静脈瘤、深部静脈血栓症といった疾患を扱い、診断から手術・血管内治療まで一貫して診療を進めています。血管外科で扱う症例数は年間580例を超えます。豊富な症例数を元に、全国的な臨床研究および治験を積極的に行い医療技術の進歩に貢献しています。また、救急に関しては、松山医療圏の二次救急医療を担っており、消化管穿孔、腸閉塞、胆嚢炎、虫垂炎などの急性腹症、外傷、および動脈瘤破裂などに対し外科的治療を行っています。

以上より当院外科においては、幅広い分野での外科疾患について、診断から外科治療までの研修が可能です。